敵小隊
敵の大型空母からは時々、複数の敵機からなる敵小隊が出現してコーネリアへ向かっていく。敵小隊とはマップ上で接触する事で戦闘に入り、撃墜する事が可能。放っておいてもサテライトシステムが自動で撃墜する事もあるが、敵がコーネリア上空に到達するとダメージを与え続けるので早めの処理を心がけよう。
ナイトファング
低難度や序盤によく出現する敵機。耐久値は非常に低く、ブラスターが1発でも当たれば撃墜できる。しかし散開して周囲を飛び回る上、数が減るとエリア外に逃走する事もあるので地味に時間を奪われがち。
ハルバード
アンドルフ軍の戦闘機。ナイトファングと一緒に出現する事も多い。耐久値が低い点はナイトファングと同じだが、こちらの後方に回り込んでレーザーを撃ってきたりと攻撃行動が多い模様。常にレーダーを確認して近い機体から片付けるようにしたい。
スパイラルカイト
大きい翼が特徴的な戦闘機。他の小型の戦闘機と小隊を組んでいる事が多い。機動性が高く移動が速いものの、攻撃時は停止する上に脆いのでハルバード等よりも落としやすい。戦闘が始まったら早々に撃墜し、残った他の敵の処理に集中するのが良いだろう。
スカルトード
大型の戦闘機で、耐久値は高め。スピードは遅いがプラズマボールを放ち、当たると大ダメージを受けてしまう。攻撃される前に早めに撃破し、それから残った護衛機の処理していくのが良いだろう。
スカイキッカー
その名の通り空中をバタ足で泳いでいるような動きで飛び回る戦闘機。複数で出現し、散開した後こちらの死角から接近して攻撃してくる、意外と厄介な敵。耐久値は低くブラスター1発で撃ち落とせるが、的が小さい上によく動くので攻撃を当てるのは難しい。ブレーキを入れつつレーダーで接近してくる個体を確認し、近寄ってきた所を迎撃すると処理しやすい。
キャノンボンバー
エイのような形をした大型の爆撃機。機雷らしき物を落として攻撃してくる敵で、耐久値が高めなので通常のブラスターだと撃破に時間がかかる。ただし動きはゆったりとしていて狙いやすいので、慣れれば動き回る小型機よりも楽に落とせるようになるだろう。左右のヒレのような翼は本体とは別の部位となっており、破壊しても本体を倒した事にはならない点に注意。
プリズンボウ
弓のような形をした大型の攻撃機。正面にいると強力なレーザーを撃ってくるので、狙われる前に敵の攻撃範囲外から先手を撃って仕留めよう。機体が大きく動きも速くはないので、ツインブラスター以上なら楽に撃墜できるはずだ。
メタルブーメラン
4個のビットを伴って出現する三日月型の兵器。本体の周囲をビットが回転しており、時々動きを止めてレーザーを放つといった攻撃行動を取る。本体が大きいので狙いやすいが、先に本体を破壊してビットが残ると、ビットが別々に飛び回って処理に時間がかかってしまう。その為まずはビットを破壊し、その後で逃げ回る本体を攻撃して仕留めるのがお薦め。本体も大きく動き回るため若干狙いにくいが、ブレーキを入れつつ引いた視点で動きを追えば狙いをつけやすい。
ザ・スピナーズ
1体のリーダー機と、4つのスピナーからなる小隊。リーダー機はステルス状態になって度々姿を隠す上、周囲のスピナーもワープする事が多いため殲滅にはかなりの時間がかかる。スマートボムを使用すればスピナーはすぐに片付けられるが、ボムを使えない場合はかなりの苦戦を強いられるだろう。状況にもよるが、無理にこちらから仕留めようとせずにサテライトシステムに処理させる方が良い。もしくは出現前に速攻で空母を破壊してしまうのもお薦めだ。
ブレインスポイラー(ウィルス)
こちらは厳密には敵小隊ではなく、敵本拠地から送り込まれるウィルス。サテライトシステムはこの敵を撃ち落とさないため、こちらから接触して撃破する必要がある。マップ上で接触すると戦闘に入るが、敵からはこちらを攻撃せずに高速でエリア外へ逃げていくのでブーストで追跡しながら撃ち落とそう。ウィルスを逃がしてサテライトシステムに取りついた場合、装置に取りついたウィルスを処理しに行かなければならない。その際の手順はサテライトシステムのページを参照。